目前，中检院已具备了在食品、保健食品和化妆品方面400余项检测项目的检验检测能力，涉及理化、微生物、毒理和功能／功效等多个专业领域，形成了较强的食品、保健食品和化妆品安全监督检验能力，并顺利通过了实验室资质认定（CMA）和实验室认可（CNAS）扩项、食品检验机构资质认定（CMAF）、国家食品药品监督管理总局化妆品行政许可检验机构资质认定和保健食品注册检验机构资质认定。2013年5月14日，国家认证认可监督管理委员会、国家卫生和计划生育委员会和农业部三部委联合发布了《关于第二批食品复检机构名录的公告》，中国食品药品检定研究院名列其中，这意味着中检院按照《食品安全法》的相关要求，取得了食品复检机构的资质，可承担包括食品中农药残留、兽药残留、重金属、非法添加物、食品添加剂、其它有毒有害物质、生物毒素 、营养成分、致病微生物等类项目的复检工作。
在媒体开放日期间，中检院食品化妆品检测的相关负责人还详细介绍了目前广为关注的食品化妆品中非法添加物检测方法、检测流程，以及该院在这方面的检测能力；奶粉质量检测、肉品掺假分析、食物过敏原的免疫检测等。据称，为了紧紧围绕食品药品安全监管工作需要，适应监督管理新体制要求，中检院还将从能力建设、体系建设、自身建设等多个方面入手，建立完善的食品化妆品检验检测体系，提升检验检测能力。
中检院是国家检验药品生物制品质量的法定机构和最高技术仲裁机构，依法承担实施药品、生物制品、医疗器械、食品、保健食品、化妆品、实验动物、包装材料等多领域产品的审批注册检验、进口检验、监督检验、安全评价及生物制品批签发，负责国家药品、医疗器械标准物质和生产检定用菌毒种的研究、分发和管理，开展相关技术研究工作。每年检验各类药品、生物制品、医疗器械等近万件。
