此前，来自患者的样本被送往各州和联邦实验室，然后由疾病诊断专家查看这些传染是否由同一种细菌导致。在进行足量对比分析之后，传染病学家开始询问患者，寻找导致该疾病的同一种食物来源。
但这样的测试并不能一锤定音，而把一个传染案例和另一个案例联系在一起又要花费额外的时间。“当这一切在进行时，很多被污染的农产品已经接触到公众。”美国食品药品监督管理局（FDA）食品安全与应用营养科学实践办公室副主任Steven Musser说。
现在，FDA正在构建一个联邦州及联邦实验室网络，以帮助绘制李斯特菌、沙门氏菌和其他食源性病原体的准确DNA。这些测出来的序列会被上传到位于国立卫生研究院的公共数据库中。该技术不仅可以把一种病原体和其他多种类似菌种区分开，还可以表明同一个菌株发生的细微异变。
与此同时，FDA已经开始对日常植物检查中发现的病原体进行测序，并把结果加入该数据库。该机构表示，这种做法的一大优点是可以迅速把病人和一次疫病联系在一起。另一个优势是，在一些患者生病后，可以辨别发病源，缩短常规检查所需的时间，减少了被感染农产品走上货架带来的大面积传播的风险。
